PrimerPlex官方版是一款設計非常專業(yè)的多重PCR引物設計軟件，PrimerPlex官方版擁有直觀的操作界面，其軟件主要用于基因表達分析、PCR引物設計、SNP檢測和高吞吐量基因分析、綜合檢測等，非常的簡單實用。

功能介紹

      1、多重SNP檢測和高吞吐量基因分型

      使用PrimerPlex，您可以設計在SNP側翼的多重PCR引物，3'末端具有SNP的ASPE引物，并在其中心捕獲具有SNP的探針。 PrimerPlex可以通過為每個基因組序列設計寡核苷酸來檢測中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針的多重性，并顯示最佳可能的集合。

      2、多重PCR引物設計

      設計適用于多重測定的引物組可能是一項具有挑戰(zhàn)性的任務。 PrimerPlex使用創(chuàng)新和專有的算法來設計最佳多路復用引物組，從而最大限度地減少Tm失配。分析所有組的交叉反應性，以確保特異性和有效的擴增。您可以從以不同排序順序呈現(xiàn)的替代品列表中選擇最適合您實驗需要的套件。使用PrimerPlex，您可以靈活地將引物設計成3'端，5'端，距離這些末端或序列內任何地方都有特定的距離。

      對于SNP基因分型測定，該程序設計側翼突變的引物，如SNP，DIP(缺失/插入多態(tài)性)和MNP(多核苷酸多態(tài)性)。

      3、綜合檢測支持

      使用PrimerPlex，設計寡核苷酸用于多重PCR，ASPE和直接雜交測定。寡核苷酸被篩選為交叉反應性，以確保高信號強度，使Tm失配最小化。寡核苷酸被篩選為二聚體，運行和重復。

      4、下一代測序法

      使用PrimePlex，設計用于預先測序樣品制備和突變檢測的多重寡核苷酸，如SNP，DIP(缺失/插入多態(tài)性)和MNP(多核苷酸多態(tài)性)與點擊幾個按鈕一樣簡單。

      5、引物特異性

      程序BLAST在單次搜索運行中搜索多個序列。結果自動解釋，并且在引物設計期間避免了識別的同源性，確保設計具有高度的特異性。

      6、評估預先設計的引物和探針

      PrimerPlex可以使用預先設計良好的寡核苷酸來構建多重集合。在為每個序列指定寡核苷酸后，分析其屬性，并向用戶發(fā)出所發(fā)現(xiàn)的任何偏差。對于預先設計的寡核苷酸不可用的序列，PrimerPlex設計它們，檢查它們的多重性，并突出顯示兼容性問題(如果有的話)。然后，用戶可以決定接受設計或創(chuàng)建單獨的池。該功能可以完全控制用戶手中。

      7、添加MagPlex標簽

      該程序現(xiàn)在還支持MagPlex TAG數(shù)據(jù)庫以及MicroPlex xTAG(以前稱為FlexMAP TAG)，用于在每個ASPE引物上自動添加適當?shù)臉撕�。標簽被選擇為使得它們最小化二聚化，并且不折疊在它們所連接的寡核苷酸上。此外，用戶可以覆蓋程序的建議，并自行選擇一個標簽。如果標簽不是唯一的，或者選擇的標簽與oligo不兼容，PrimerPlex會提醒用戶。